Expertos del Centro de Regulación Genómica (CRG) de Barcelona han generado una nueva herramienta que permite el uso de moléculas de ácido ribonucleico de transferencia (tRNA) como biomarcadores para diagnosticar cánceres y hacerlo en un futuro próximo en menos de tres horas y a un precio de menos de 50 euros la muestra, es decir, menos de mil pesos mexicanos.
Los científicos, que publican su trabajo este jueves en la revista ‘Nature Biotechnology’, logró por primera vez desarrollar un método para medir la abundancia y modificaciones de tRNA de una manera simple y económica, con aplicaciones prometedoras para diagnosticar y predecir enfermedades, y que además es una prueba no invasiva, con alta especificidad.
El método ha sido generado por el grupo de investigación de Eva Novoa en el CRG de Barcelona y, con financiación de la Asociación Española Contra el Cáncer, ahora lo están usando como base para desarrollar un nuevo kit y plataforma que puedes encontrar si una muestra biológica es cancerosa y predice su malignidad en menos de 3 horas y al precio mencionado, indica EFE.
Como explicó Novoa, cuando las moléculas de ácido ribonucleico de transferencia (ARNt) se modifican incorrectamente, producen proteínas defectuosas o incompletas, lo que está asociado con varias enfermedades humanas, incluidas las neurodegenerativas, metabólicas y el cáncer.
“Los tRNAs son moléculas que contienen mucha información, con un enorme potencial para el diagnóstico y pronóstico de enfermedades y hasta ahora no han sido explotadas por la falta de métodos que puedan capturar esta información de forma cuantitativa y rentable”, según el investigador, que pone como ejemplo que algunos tipos de cáncer son difíciles de diagnosticar porque sus síntomas no son específicos y pueden confundirse con otras enfermedades.
“Poder aislar moléculas de ARNt de muestras de sangre y cuantificar sus modificaciones puede ayudar a diagnosticar cánceres sin usar pruebas de imagen o biopsias invasivas. Además, el tipo de modificaciones de ARNt puede cambiar según el estado de la enfermedad, lo que brinda información valiosa”, agregó Novoa.
Los métodos que se utilizan actualmente para medir moléculas de ARNt generalmente involucran técnicas como la secuenciación de próxima generación o la espectrometría de masas, con limitaciones en el diagnóstico porque no pueden detectar las modificaciones o no son capaces de identificar en qué punto de la molécula de ARNt se encuentran.
Este nuevo método, denominado Nano-tRNAseq, según los científicos del CRG, puede medir tanto la abundancia como los cambios de las moléculas de ARNt en un solo paso y se basa en la secuenciación de nanoporos, una tecnología que puede secuenciar moléculas de ARN directamente pasándolas a través de un pequeño poro y detectar cambios en la corriente eléctrica que se genera cuando cada nucleótido pasa a través del poro.
“Antes dependíamos de dos métodos separados que son menos informativos, tomaría semanas y costaría miles de euros para obtener resultados. Nano-tRNAseq es mucho más barato y podemos tener resultados en un par de días. En un futuro cercano, estar en unas horas”, comentó la investigadora del CRG Morghan Lucas.
Otra ventaja es que las máquinas de secuenciación de nanoporos utilizan Nano-tRNAseq son pequeños, livianos y pueden ser alimentados por una computadora portátil o una batería externa, haciéndolos fáciles de transportar y permitiendo su uso en el campo o en la clínica.
Todavía hay algunas complicaciones en el nuevo método, que ha sido probado con ARNt de levadura, Lucas afirma “que el uso de Nano-tRNAseq en paralelo con otros métodos hace posible describir los perfiles de modificación del conjunto completo de ARNt en humanos y, en el futuro, usar Nano-tRNAseq para identificar qué cambios en los ARNt están asociados con una determinada enfermedad”.
“Nano-tRNAseq es una tecnología de prueba de concepto que allana el camino para desarrollar un método simple, económico y de alta precisión que puede cuantificar de forma no invasiva estas moléculas. Nuestro objetivo es seguir desarrollando esta tecnología y combinarla con herramientas de inteligencia artificial. determinar la malignidad de una muestra biológica en menos de 3 horas y con un coste no superior a 50 euros por muestra”, concluye Novoa.
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